이번에 새로 들어가게 된 PennSIVE

이번에 새로 들어가게 된 PennSIVE

 Penn Biostatistics Ph.D. 프로그램은 1학년들에게 매 학기, 그리고 여름동안 Lab rotation을 돌게 한다. 이는 학생들에게 8주-10주의 프로젝트를 통해 Biostatistics의 다양한 분야를 경험하게 하고 이를 통해 추후 dissertation advisor를 정하는 데 도움이 되도록 한다. 나는 가을 학기에는 EHR lab에서 rotation을 했으며 이번 봄학기에는 PennSIVE에서 rotation을 했다. 그리고 이번 여름 학기에도 이 랩에서 rotation을 할 예정이다. 

 이번 포스팅에서는 내가 이번 봄학기, 그리고 이번 여름 일을 하게 된 PennSIVE에 대한 소개를 하고자 한다!

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 메인 홈페이지: PennSIVE

 PennSIVE는 Penn Statistics in Imaging and Visualization Endeavor 라는 그룹의 약자로 Statistical Imaging을 연구하는 그룹이다. 특히 Biostatistics 학과에서의 Imageing 연구는 Brain cancer, Multiple Sclerosis, Alzheimer disease 와 관련하여 진행되고 있다. 

메인 홈페이지에서 가져온 PennSIVE의 연구

Statistical theory에서부터 functional MRI data analysis 까지 이론과 실전을 모두 병행하여 연구하고 있으며, Biometrics부터 Journal of Neuroscience까지 폭넓은 저널에 논문을 내고 있다.

 이 그룹의 PI는 Dr. Russel T Shinohara 로 "In 2013, he was the youngest principal investigator in the nation in 20 years to receive an R01 award at the age of 27" (출처: https://www.jhsph.edu/departments/biostatistics/alumni/alumni-profiles/taki-shinohara.html) 이다.

 게다가 사교적이시고 / 학생을 위해주실 줄 알며 / 쿨하시다. 정말 완벽한 advisor가 아닐 수 없다. (예를 들면, 교수님과 최근에 미팅을 했는데 칵테일 뭐 마시냐에서 시작해서 어디서 이 코로나 시국에 술을 구하는가 까지에 대한 이야기를 한다. 어떤 교수님과 이런 이야기를 할 수 있을까!)

 그 이외에도 Dr. Haochang Shou, Dr. Kristin Linn 교수님들이 이 그룹에 참여하고 계시다.

 최근 빅데이터 연구가 각광을 받고 있는 시기에, 그 빅데이터를 연구한다고 할 수 있는 PennSIVE 그룹은 그 규모가 굉장히 커져서 현재는 센터급으로 성장하게 되었다.

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 내가 이번 봄에 진행한 연구는 Oligodendrocytes를 segment하는 통계적 모델링을 하는 것이었다. Original question / dataset은 Bioxriv 에서 확인할 수 있다.

  나의 연구는  Oligodendrocytes를 manually segment하지 않아도 segment할 수 있는 방법론을 제시하는 것이었으며, 현재는 내가 고안한 방법을 평가하는 중이다 :)

 나에게는 완전하게 새로운 분야이지만 (아직까지는) 굉장히 재미있다! 그리고 다양한 machine learning 방법론을 적용할 수 있다는 점에서 굉장히 매력적인 분야인 것 같다.

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- Statistical method in Biostatistics에 관심이 있고, 배우고싶다면 이 Coursera를 추천한다: https://www.coursera.org/learn/neurohacking

- Follow PennSIVE on twitter: https://twitter.com/penn_sive

- Follow Dr. Russel T Shinohara on twitter: https://twitter.com/takishinohara