Lightning talks in Harvard, 3rd round in 2018

2018년 봄학기의 마지막 Lightning Talk!
학과장님이신 Xihong교수님, 하버드 Biostat 박사과정 dean이신 Paige 교수님 등 엄청난 교수님들의 화려한 라인업이었다. 이름값 만큼이나 Lightning talk는 5분의 talk라기보다는 lecture같았다. 녹화된 talk는 여기서 : Facebook Live link

1. Franziska Michor

 - Title: DNA methylation profiling of DNA for noninvasive early cancer detection.
 (cf) DNA profiling of cancer-causing mutations

 - Prognostic test, blood를 통해서
 - Extraembroyonic tissues have a cancer-like methylome.
  -> "Embroyonic" vs "Extra embryonic"
 - Mouse genome -> Human genome

 - "Methylation status"
 - Exe-Hyper-CGIs can predict the cell type of origin.

 - blood test를 하면 mutation에 따라 수많은 cancer의 risk를 estimate할 수 있지만, specific한 암에 대한 risk를 찾는 거는 또 다른 문제이다...

TED 에서 발표하시는 교수님

2. Michael Hughs: AIDS 연구를 이끌어 가는 cBAR의 대장님!

 - Title: Two study design question in infectious disease (Clinical Design)

(1) Convalescent plasma
 - Hospital patients -> Randomize -> High dose/Low dose 하는 상황
  -> What to do in a trial of a seasonal infection when sample size is not achieved at the end of the season?
  -> If continue for another season, sample size would increase. Then, can we relax efficacy? How about the alpha level?

 (2) Cluster randomized prevention trial
 - High risk cluster에서 벗어나는 것
 - Test a random sample of contros, or test everyone in a random. Sample of clusters?

3. Xihong Lin: 하버드 Biostat 대장님!

 - Title: Scalable statistical inference of massive genome exposome and phenome data.

 - Whole genome sequencing: exposure data, electronic medical records를 통해서

 -  인간의 3 billion basepairs, ACTG: whole genome sequencing
  => Current status in TOPMed: 40 projects, p>500M genetic variants
  => GSP (Genome Sequencing Program)

 (1) WGS Analysis
  - Signal detection: rare & weak --- which is sparse. (*) Jun Liu교수님의 2017년 Final 문제.. signal profiling -_-..
  - High dimensional dense & spare alternatives
  - Multiple phenotype (Multiple outcomes)
  - Risk prediction

 (2) Integrative analysis of different types and source of data
  - High-dimensional causal meditation analysis: 이거 Giovanni 교수님도 관심있어 하시는 건데...

 (3) Analysis of biobank data
  - Biobank: Genome + EMR + Epidemiology + Imaging data + Wearable devices data
  - Biobank는 현재 UK가 가장 잘 되어있다.

4. Paige Williams

 - Title: Reproductive outcomes and ART

 (1) Endoctrine disrupting chemicals(EDCs) and outcomes of Assisted Reproductive Technology(ART)
 (2) Antiretroviral treatment(ART (?)) and adverse pregnancy outcomes among woman with HIV

 - Gestational period is so~~ important

 - Analysis of the IVF data
 - Combinations of drugs


 - 생물 공부를 더 해야겠다. 생물통계학과에서 살아남으려면... 난 왜 생물통계학과를 왔지 ㅠㅠ 경영대학에서 수학과에서 생물통계학과라니... 너무 멀리 왔다.